Z oceánu se vynořily nové ostrovy a vy jako vědci musíte zkoumat nové, rozvíjející se ekosystémy. Sledujte, jak se ostrovy na hrací ploše rozrůstají ve třech rozměrech, jak se o nich dozvídáte více, a přidávejte na jednotlivé ostrovy barevné rostliny a živočichy, jak budete zkoumat jejich ekosystémy.
V každém kole hry Emerge získáváte body házením kostkami a jejich používáním ke shromažďování poznatků a objevů. Všichni hráči začínají se stejnou výzkumnou deskou, ale v průběhu hry si můžete vlastní desku upravovat a měnit, co zkoumáte. Po osmi kolech získáte body podle toho, jak kvetoucí a biologicky rozmanité jsou vaše ostrovy, a také podle různých výzkumných cílů.