Mnoho let po událostech původní hry Astro Knights padne velké břímě na skupinu otrhanců. Ti sice mají v rukou velkou moc, ale zároveň i velkou odpovědnost. Jejich úkolem je zlikvidovat hrozby, které jim jdou naproti.
Astro Knights Eternity je samostatně hratelná kooperativní karetní hra, která klade důraz na příběh a efektivní spolupráci. Úkolem hráčů je společnými silami porazit protivníka, který se vás taktéž snaží zlikvidovat. Hra si bere vzor z Aeon's End (česky Konec věků), tudíž ani v této hře se nemíchají balíčky s odloženými kartami. Avšak místo fantasy zasazení je tato hra zasazena do vesmíru.