Princip hry Naruto: Ninja Arena je jednoduchý: Mrsknete kostkami, aktivujete tím bojové techniky, zraníte své oponenty, zahrajete různé schopnosti a takto dokola, dokud neodpadnou všichni krom jediného. Na výběr máte z 10 různých bojovníků a kostkami házíte v reálném čase (to jest že hra není na kola a všichni hrají dohromady) a co nejrychleji, takže hra je díky tomu lehce chaotická a frenetická.